南京工業大學國家大學科技園採用“一園三區，跨江發展”的模式。在南京工業大學模範馬路校區的八萬平米科技創新大樓是孵化創新區；在南京高新開發區的是三創載體人才基地；在浦口經濟開發區的南京工大科技產業園的是產業中試、企業孵化基地。科技園利用學校強大的信息網絡資源，把三區緊密有機地聯結起來，並在數字化層面成爲一個園區。